Dla każdego pręta w projekcie musi być określony kształt jego przekroju poprzecznego. Program R3D3-Rama3D umożliwia tworzenie przekrojów pojedynczych lub złożonych o dowolnym kształcie, a także przekrojów pojedynczych o zmiennej geometrii. Wszystkie charakterystyki geometryczne przekroju są automatycznie obliczane przez program.