Dokładnie w taki sam sposób, w jaki można dodawać nowe kondygnacje do projektu, można kasować istniejące już kondygnacje. Po wybraniu odpowiedniego punktu menu, pojawia się poniższe okno dialogowe:
Do tego okna wprowadza się decyzję jak należy postąpić z pozostałymi kondygnacjami. Po potwierdzeniu tego okna dialogowego za pomocą OK, dana kondygnacja zostaje skasowana. Celem zabezpieczenia się przed niezamierzonym skasowanie, ArCon zapytuje ponownie w oddzielnym oknie dialogowym, czy dana kondygnacja ma być rzeczywiście skasowana. Funkcja Przerwij umożliwia zapobieżenie tej akcji. Jeżeli pytanie zostanie potwierdzone za pomocą OK, to skasowana zostanie ta kondygnacja łącznie ze wszystkimi informacjami, które były zapisane dla tej kondygnacji (ściany, drzwi, okna, wyposażenie, a także również teksty, linie pomocnicze itp.).